歼灭文钦主力之后，晋军开赴项城，包围毋丘俭及其余部，王基的先锋部队首当其冲，势在攻城。淮军主力已然覆灭，区区残部无力回天。毋丘俭自感大势已去，便领残部于晋军再度合围前弃城突围。晋军趁胜追击，淮军越打越少。毋丘俭逃至慎县境内，得知寿春已被诸葛诞袭击占领，归路已绝时，最后的部队也开始军心涣散，出现士兵大量逃亡。毋丘俭不甘失败，调整路线，改道北上，（欲至幽州东山再起）。追兵穷追不舍，布下天罗地网。毋丘俭一众露宿荒野，饥疲交加。至慎县安丰津境内，遭遇追兵，毋丘俭与小弟毋丘秀和孙毋丘重藏匿在河边芦苇丛中，中箭而亡。平民张属因射杀毋丘俭而被封侯。毋丘秀、毋丘重却得以幸免，随文钦、文鸯逃入东吴，淮军其余将士或降或死。但其长子毋丘甸以及在洛阳为质的亲族全部受牵连被杀。
后来西晋灭吴，其在东吴的子孙得晋朝赦免，重返中原，并得以为官。毋丘俭之孙毋丘奥，任晋朝巴东监军、益州刺史。
毋丘俭转任镇东将军，击退诸葛恪北伐后，对魏帝曹芳上疏：“战争中，我有一个很英勇的传令兵叫刘整，很有骨气。他被贼兵抓住后，受到严刑拷打，逼问情报，吴人劝降他：“诸葛恪大人想饶你一命，你可屈服？”刘整说：“死狗，这是什么话？我宁愿去死，做大魏国的亡魂来追杀你，要杀快杀，不求苟活。”然后闭口不言，自始至终都没有出卖我们，还有一个郑像的士兵也很英勇.....我觉得他们很有节操，请陛下您表彰上述这些英烈官兵的忠义之举，慰劳奖赏他们的家属。“死狗，此何言也！”
杜挚一心寄希望于毋丘俭，多次写信借离群孤鸿自喻，嘘声叹气，抱怨自己怀才不遇的困境，用卖惨的方式暗示老乡引荐做官，毋丘俭不满同乡的消极态度，借凤鸟而喻，委婉而严肃地指出问题所在：“（阁下是）凤鸟，想在洛阳展翅飞翔（得到重用），于是在鸣叫中表达诉求。应时而出的杰出人才啊，您美丽的歌喉为什么总要发出自轻自贱的声音呢？（埋怨世道的不公呢？）””出自其作品《答杜挚》：“凤鸟翔京邑，哀鸣有所思。才为盛世出，德音何不怡？”
高句丽王屡次挑衅魏国，其部下沛者得来劝谏国王罢手，苦苦哀求未果，最终绝食而死。人们非常怀念他。毋丘俭知道这件事后，十分尊重已故的得来，在攻破丸都城那天，特别交代正在屠城泄愤的士兵，不得加害沛者得来的家属，释放已经抓获的得来遗孀以及儿女。并派人保护已经过世的得来墓碑免受乱军破坏。束马悬车，屠句骊所都，俭令诸军不坏其墓，不伐其树，得其妻子，皆放遣之。
毋丘俭的家族和风水学颇有渊源。起兵之前，管辂曾路过毋丘家的祖墓，靠在树边哀叹说：“林木虽茂，无形可久；碑诔虽美，无后可守。玄武藏头，苍龙无足，白虎衔尸，朱雀悲哭，四危以备，法当灭族，不过两载，其应至矣”后裔之一丘延翰成为中国历史上第二代风水祖师，第二代易学、堪舆学的伟大传承者。
“千载风尘，思尽躯命，以完全社稷、安主为效。斯义苟立，虽焚妻子，吞炭漆身，死而不恨也。”其在檄文中写道。曹氏政权为数不多、且言行一致、没有争议的忠臣之一。自晋朝以来史学家们高度称赞的忠臣良将。（其倾家赤族，满门忠烈，幼弟随事军中，助兄征战，长子甸不顾个人安危，劝父起兵，次子宗有其父之风，孙子毋丘奥更是得到晋朝皇帝的重用，官至益州刺史。在“淮南三叛”中，观三任主要参与人的言行。王凌计划另立新君，与洛阳朝廷分庭抗礼，文钦、诸葛诞均有投降吴国，接受吴国官职委派以及乞邀东吴大军，入寇祖国的记录。毋丘俭作为抗吴多年的魏国东线边帅，独善其身，倾尽东南之兵，奋力西向，几乎以一州之力对抗司马氏控制的全国兵马。即便如此，仍预留士兵戍守边防，驻防家国重镇，不割地，不献城，不称臣，不妥协。不曾做出任何通敌资敌之举。魏帝曹髦在三次淮南事变结束后，连续三次下诏斥责诸葛诞，而未曾对毋丘俭下过批判，至少三国志魏书里面没有记载。无论出发点如何，观其言行，印证后世史学家们的定义，站在曹氏的立场来看，毋丘俭乃鞠躬尽瘁，忠心不二的忠臣毋庸置疑，观其一生，确有国士之风。