要明白朱厚照身为大明的皇帝也仅仅只敢打个擦边球，而不是像处理朝臣那样不管三七二十一拿起刀就杀。就首先要明白什么是卫所制度。
明太祖朱重八在经过多年努力，在统一南方挥师北伐后，建立了明朝。由于当时战乱刚刚结束，明朝还是处于马上打天下的状态，所以明军数量相当庞大。具《明史》记载：“国初置卫四百九十一，所三百一十一。”按现在大部分认可的换算法，一卫大约按5600人计算，那明初有三百万上下的军队。
这对于刚刚饱受战乱、灾害、疾病，急需恢复生产的明朝而言，是个沉重的负担。
对于几百万明军，在边疆趋于稳定要把目光转移到生产上来的朱元璋，肯定是不会将他们裁撤掉的。大规模裁撤，估计后面李自成的故事就要提前上演。除了大天朝也没有敢裁军百万。
为了维持社会稳定，不威胁刚刚建立的大明王朝，卫所制就是不二之选。简单点讲，卫所制，就是老子是军人，儿子也必须是军人，世世代代，不可变更！当军户有个好处，就是朝庭发给土地，让军户们自己养活自己，有仗打的时候，就是兵，没仗可打，就乖乖的当农民。
其实，这也不能怪朱元璋。朱元璋自己就是贫苦农民出身，所以他能深刻体会到严苛的税赋对于农民意味着什么？朱元璋曾说：“今海内宁谧、边境无虞，若使兵但坐食于农，农必受弊，非长治久安之术，其令天下卫所，督兵屯种，庶几兵农合一，国用以舒。”
这也就是朱元璋的初衷，几百万人都坐在那里吃皇粮肯定是不行的。所以，把这些青壮劳力分配去种地也是不错的选择。正所谓“军士三分守城、七分屯种”，内地更是“两分守城，八分屯田”当然，根据土地贫瘠程度会有一些调整。但是屯田所得的粮食超过一半要作为“籽粒”上交，甚至许多地区剥削比例高达七成以上。名义上，籽粒是归国家所有、供作战的旗军作为军粮使用，但实质上则是被世袭军官所支配。
世袭武将更是大量夺取卫所屯田、奴役军户来进行耕种，以维持自己的私兵部队。这种情况就造成了明朝中后期有个很奇怪的现象：召募兵强于卫所兵，而家丁，则强于召募兵，站在家丁们最顶层的，就是各大豪门的家丁亲兵。大汉奸吴三桂少年时也曾勇猛过人，单身冲进建虏阵中救父，所带领的，就是家丁。
我们说卫所士兵战斗力羸弱，从他建立的那一刻似乎就已经注定了。因为，他的本身的目的就是要将庞大的军事人口转移到社会生产中去。只是后来由于土地的持续兼并以及大量的利益群体盘根错节，明朝统治阶级想取缔掉卫所制度已经不太现实了。
而这一切，一生戎马的成祖朱棣早就已经意识到了。在他“靖难之役”以及后来征蒙古的战事中，明军战斗力的下滑就已经有所体现。意识到问题的朱棣，在将大明的都城迁到北京后，永乐时确立了九边总兵制度，由中央下辖的兵部进行管理，与这一体系相适应，便产生了营兵制，而朱老四更是一手打造了历史上大名鼎鼎的京营。随着京营建立，明军就拥有了二十多万常备军。而且在之后的九边重镇，也逐步以职业军人取代卫所士兵。可是，广大的内地由于种种原因，卫所制度还是保留了下来形成了一个尾大不掉的局面。